大闸蟹死亡的原因主要有以下几点：
大闸蟹在水中通过鳃呼吸，如果水中的氧气耗尽，它们就会因缺氧而死亡。在密封的储存盒中，如果存放时间过长，空气被消耗，大闸蟹也会因缺氧而窒息。
在养殖环境中，如果池塘中的氧气含量不足，或者因为养殖密度过高、饲料过多等原因导致溶氧量下降，大闸蟹也会因缺氧而死亡。
大闸蟹死后，体内容易滋生细菌，尤其是组氧酸分解产生组胺，这是一种有毒物质。随着死亡时间的延长，组胺等毒素积累越来越多，即使通过烹饪也无法完全消除这些毒素和细菌。
死掉的大闸蟹体内还会产生尸胺和组胺等有毒物质，食用后可能导致食物中毒，出现腹泻、恶心、呕吐等症状。
如果蟹塘水质恶劣，含有有毒或有害物质，或者水体中病菌过多，会导致大闸蟹被细菌感染，严重时死亡。
水体酸碱度过高或过低、水温过高、溶氧量不足等环境因素也会对大闸蟹的健康产生不利影响，导致死亡。
在高温天气或暴雨过后，蟹塘内水体环境被破坏，容易让大闸蟹产生应激反应，突然出现死亡的情况。
大闸蟹在脱壳后，软壳蟹对外界环境的要求很高，如果水体环境不良，它们可能无法成功脱壳，导致死亡。
综上所述，大闸蟹死亡的原因主要包括缺氧、细菌滋生与毒素产生、水质问题、应激反应以及脱壳失败等。为了确保大闸蟹的健康和生存，建议在储存和养殖过程中注意保持适宜的环境条件，及时清理水质，避免疾病的发生和传播。