昭阳区目前存在两家法院，分别是：
昭通市昭阳区人民法院，其前身是建立于1950年3月的昭通县人民法院，后历经了昭通县人民法院、县级昭通市人民法院等阶段的发展变迁。2010年1月，随着国务院对昭通行政区划的重新调整，原昭通市人民法院正式更名为昭阳区人民法院。昭阳区人民法院在昭通市法院系统中历史最悠久，规模也最大。法院审判办公楼现坐落于昭通市昭阳区正义路100号。全院现有干警109人，90%以上具有法律本科以上学历，高学历、高素质人才比例在全市法院系统处于较高水平。昭阳区法院下设多个庭室和部门，包括立案庭、刑事审判一庭、刑事审判二庭、民事审判一庭、民事审判二庭、行政庭、审判监督庭、执行局、执行裁判庭、执行综合科、执行实施科、调解室、小额诉讼审判庭、交通事故审判庭、法警大队、法律政策研究室、办公室、政工科、督察室、后勤装备科、计算机信息中心、审判管理办公室、书记员管理办公室、人民陪审员管理办公室、新闻宣传中心、信访办公室等，以及北闸、乐居、大山包、永丰4个基层法庭。
昭通市中级人民法院，成立于1950年4月5日。法院审判办公楼现坐落于昭通市昭阳区海楼路317号。2014年全院现有人员183人，正式在编人员149人，本科以上学历123人，占总人数的84.1%，其中硕士研究生4人，占总人数的2%。
根据以上信息，昭阳区的主要法院是昭通市昭阳区人民法院，负责昭阳区的日常审判工作，而昭通市中级人民法院则是昭通市的上级法院，负责审理重大案件和二审案件。