在路口掉头被扣分的原因通常包括以下几点：
禁止掉头标志：如果路口有明确的“禁止掉头”标志或地面标有禁止掉头的标线，此时进行掉头操作就会被扣分罚款。
未在规定的掉头区域掉头：有些路口设置了专门的掉头区域，车辆必须在该区域内掉头，否则视为违法行为。
闯红灯掉头：在红灯时越过停止线进行掉头，相当于闯红灯，会被罚款200元并扣6分。
未等绿灯亮起就掉头：在信号灯未变绿时进行掉头，尤其是压着斑马线掉头，会被视为违反交通信号，从而被扣分罚款。
未礼让直行车辆：在掉头时必须让直行车辆先行，否则可能因妨碍交通被扣分罚款。
铁路道口、桥梁、陡坡、隧道等：在这些容易发生危险的路段掉头，容易引发交通事故，因此被严格禁止并扣分罚款。
高速掉头：在高速公路入口掉头会被一次性扣12分，并处以罚款。
综上所述，在路口掉头被扣分的原因多种多样，主要是由于未遵守交通标志和标线、未遵守交通信号灯指示、影响其他交通参与者以及在不允许掉头的危险路段进行掉头。为了安全合法地掉头，驾驶员应提前观察交通标志和信号灯，确保在允许的区域内进行掉头，并严格遵守交通规则。