当物流公司丢失货物时，其赔偿责任主要依据是否保价以及相关法律规定来确定。以下是具体的赔偿方式：
如果寄件人对快递进行了保价，那么快递公司通常会按照保价金额进行赔偿。例如，如果寄件人保价时声明物品价值为5000元，并支付了相应的保价费用，当快递丢失后，快递公司应按照5000元的保价额进行赔偿。
如果快递只是部分损毁，那么会按照保价额与邮件全部价值的比例对快递的实际损失予以赔偿。
若快递公司与寄件人在快递服务合同中对未保价快递的赔偿有明确约定，且该约定符合法律规定，那么一般会按照合同约定进行赔偿。例如，有的快递公司规定未保价的快递丢失，按照运费的若干倍进行赔偿。
如果未保价的快递丢失且没有明确约定，依据《民法典》第八百三十三条规定，当事人没有约定或者约定不明确，依据民法典第五百一十条的规定仍不能确定的，按照交付或者应当交付时货物到达地的市场价格计算赔偿额。但实践中，这种情况下寄件人需要承担举证责任，证明所寄物品的实际价值。如果寄件人无法证明物品的实际价值，可能会给索赔带来一定的困难。
此外，若快递公司能够证明快递的丢失是因不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成，则不承担赔偿责任。
建议
购买保价服务：建议寄件人在邮寄重要文件或贵重物品时，选择购买保价服务，以便在货物丢失时能够获得更充分的赔偿。
保留证据：在邮寄过程中，应妥善保管相关单据，如运单号、购物发票等，以便在发生丢失或损毁时能够提供充分的证据进行索赔。
明确约定：在签订快递服务合同时，应明确约定未保价快递的赔偿方式，以减少后续纠纷。
通过以上方式，可以更好地保障寄件人的权益，确保在快递丢失时能够获得合理的赔偿。