在南通，如果机动车违章查询结果有误，可以通过以下步骤进行申诉：
提交行驶证、驾驶证、身份证等资料。
领取违章处罚决定书。
向工作人员提出申诉。
填写行政复议申请表。
带上行政复议申请表、处罚决定书、驾驶证、行驶证、身份证等资料到当地的公安部门提交申请。
申诉受理后，交管部门会重新对本次违章的违章内容和处罚作出核对，并在七个工作日内给予答复以及相应的措施。
如果对复议结果还是不服，还可以提起诉讼。
建议
提前缴纳罚款：在申诉前先将罚款缴清，这样有助于确保申诉流程的顺利进行。
了解违章详情：在申请复议之前，可以先去当地的交通支队了解违章详情，比如调看违章时的监控录像，以确认执法是否模棱两可，从而提高申诉成功的可能性。
准备齐全资料：在提交申诉时，确保所有必要的文件（如身份证、驾驶证、行驶证、处罚决定书等）都准备齐全，并且按照要求复印留存。
明确违章来源：在填写行政复议申请书时，一定要将违章的来源交待清楚，如果有视频或其他第三者的证据，也可以一并提交，这将有助于申诉的成功。
耐心等待：提交申诉后，需要耐心等待交管部门的答复和处理结果。
通过以上步骤和注意事项，可以更有效地进行违章申诉，维护自己的合法权益。