当机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分时，公安机关交通管理部门将扣留其机动车驾驶证。以下是处理流程：
公安机关交通管理部门将扣留驾驶证，并开具强制措施凭证，同时送达满分教育通知书，通知驾驶人参加满分学习和考试。
驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识的学习。
学习结束后，车辆管理所将在二十日内对驾驶人进行道路交通安全法律、法规和相关知识的考试（科目一考试）。考试合格的，记分予以清除，并发还机动车驾驶证；考试不合格的，驾驶人需要继续参加学习和考试。
如果驾驶人拒不参加公安机关交通管理部门通知的学习，也不接受考试的，由公安机关交通管理部门公告其机动车驾驶证停止使用。
到车管业务大厅满分查询窗口开具《交通违法满分预约联系单》，扣留驾驶证；
到驾驶人安全教育学校参加七天《道路交通安全法律、法规》培训；
到车管所参加科目一考试；
考试合格后到车管业务大厅满分查询窗口办理清分，领回驾驶证。
驾驶证扣满12分学习所需提交的资料包括：驾驶证原件、申请人的身份证明。
总结：
当驾驶证扣满12分时，驾驶人需要按照相关规定参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识的学习，并通过科目一考试。考试合格后，记分将被清除，并发还驾驶证；考试不合格的，需要继续参加学习和考试。拒不参加学习或考试的，驾驶证将被公告停止使用。