深圳对限行违章的处理如下：
违反限行规定的车辆，将面临罚款200元及记3分的处罚。
执法管理上采取民警现场执法和电子警察非现场执法相结合的方式。
对于在限行区域外围或周边道路“掐点”等候的车辆，也将进行严格管理，并依法予以处罚。
在限行时段前已驶入城市快速路（高架道路）的，应在限行时段开始前驶离，若未能及时驶离，则应在最近一个出口驶出。
一个限行周期内前两次违规不予处罚，第三次起将受到罚款300元及记3分的处罚。
每辆外地车一个工作日在限行时段在多条限行路段被多次记录的，交警部门只做一次违法记录，只处罚一次。
非本市核发机动车号牌载客汽车前两次在本通告禁行区域内违反禁行规定的，不予处罚，自第三次违反禁行规定起进行罚款处罚。
限行违章前两次可以申诉免罚，第三次开始，每次扣三分罚款三百元。
建议：
外地车主应注意限行规定，合理安排出行时间，避免违规。
可以通过微信公众号【车主指南】回复【深圳限行】查询限行信息，以便更准确地遵守限行措施。